斬札ウィンは命懸けのデュエルの果てに、謎の少女クリスタから「クリスタルカード」を託される。それが失われた記憶と関係があると知ったウィンは、ニイカと共にカードに秘められた謎を調べるため、とあるカードショップへと向かう事に。

一方その頃、都内では「人々の心臓が抜かれる」という怪事件が巻き起こる。その裏には「黒き死神」と呼ばれる男──黒城凶死郎の姿があった。

クリスタルカードの正体とは。黒城凶死郎が操る禁忌の力「同化」とは。そして彼の真の目的とは。記憶とクリスタルカードを巡り、ウィンの運命が廻り出す。